برای انتخاب پمپ باید فاکتورهای مختلفی را مد نظر قرار دهید که توان پمپ، دبی سیستم و هد پمپ از مهم‌ترین آنهاست.
پمپ‌ تصفیه استخر در اندازه‌ و توان‌های مختلف موجود می باشد. واحد سنجش توان پمپ، اسب بخار است که از 0.75 اسب بخار تا 15 اسب بخار (با توجه به نوع کاربری) متغیر می‌باشد. معمولاً پیشنهاد می‌شود که فیلتر تصفیه‌ی بزرگتری برای استخرتان انتخاب کنید اما انتخاب پمپ بزرگتر، کار درستی نیست. اگر اندازه و توان پمپی که انتخاب می‌کنید بیش از حد بالا باشد، مقداری آبی که پمپاژ می‌شود، بیشتر از ظرفیت فیلتر شما است. این امر علاوه بر آنکه به فیلتر شما آسیب وارد می‌کند، باعث می‌شود که فشار مضاعفی به پمپ وارد شده و عمر آن کاهش یابد.
دبی (آهنگ جریان)، در واقع مقدار آبی است که در واحد زمان از مقطع مشخصی عبور می‌کند. با این تعریف می‌توان گفت که دبی سیستم یعنی چقدر زمان می‌برد تا تمام آب استخر از فیلتر تصفیه عبور کند. برای حفظ کیفیت آب، سیستم فیلتراسیون باید بتواند تمام آب استخر را در کمتر از شش ساعت، به طور ایده آل در 4 ساعت، و آب جکوزی را در 20 تا 30 دقیقه تصفیه کند.
هد به صورت مقاومتی تعریف می‌شود که آب باید در خط مکش و خط دهش بر آن غلبه کند؛ این مقاومت می‌تواند ناشی از وزن آب (فشار استاتیکی)، حرکت آب در سیستم (فشار دینامیکی یا فشار ضربه‌ای) یا ناشی از اصطکاکی باشد که بین سیال و لوله‌ اتفاق می‌افتد (افت فشار اصطکاکی). بدیهی است که مسافت عمودی که آب باید طی کند نیز بر عملکرد پمپ تأثیر می‌گذارد. برای محاسبه‌ی هد پمپ، افت فشار آب در سیستم را در نظر می‌گیریم. برای این منظور، باید تمام لوله‌ها، اتصالات، شیرها و سایر تجهیزات استخر که آب از آنها می‌گذرد را در محاسبات خود وارد کنیم.